Le rectorat est situé au sein de la caisse nationale de sécurité sociale d’Agadez, le rectorat de l’Université d'Agadez est dirigé par une équipe composée du Recteur Pr. NATATOU Ibrahim professeur titulaire du CAMES, chimie minérale et métallurgie extractive, du vice-recteur Dr. ABOUBACAR Kadri, maitre des conférences en Agronomie CAMES et le directeur de l’IUT Dr. HAMIDOU Saley Harouna maitre-assistant physique CAMES. Cette équipe est appuyée par un corps dynamique et jeune d’une quinzaine d’enseignants chercheurs et technologues toutes disciplines confondues et environ vingt-quatre (24) personnels administratif et technique assurant les services d’appui au rectorat et à la scolarité centrale.

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